MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 18251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015660	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015660	CAT	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015660	T	7	7	143	149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015660	T	6	6	176	181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015660	TAT	3	9	243	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015660	A	8	8	282	289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015660	AT	3	6	318	323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015660	T	6	6	323	328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015660	TCT	2	6	381	386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015660	TTA	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015660	T	7	7	414	420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015660	AGG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015660	AC	3	6	1831	1836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015660	T	6	6	1874	1879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015660	CAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015660	TAC	3	9	1908	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015660	CTTT	2	8	1919	1926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015660	TTTTAT	2	12	1927	1938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015660	A	9	9	1942	1950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015660	ATTT	2	8	1953	1960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015660	AGG	2	6	1972	1977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015660	GCT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015660	AGC	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015660	T	6	6	3172	3177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015660	TAAAA	2	10	3181	3190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015660	A	7	7	3187	3193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015660	AGCG	2	8	3210	3217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015660	GGAA	2	8	4598	4605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015660	CCG	2	6	6572	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015660	T	8	8	6582	6589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015660	TG	3	6	9082	9087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015660	T	6	6	9120	9125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015660	CAA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015660	T	6	6	10292	10297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015660	GAA	2	6	10298	10303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015660	CAG	2	6	10314	10319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015660	AT	4	8	10356	10363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015660	A	6	6	10371	10376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015660	TTA	2	6	10403	10408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015660	GGA	2	6	10527	10532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015660	GAG	2	6	10538	10543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015660	GCC	2	6	10550	10555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015660	TGGC	2	8	10619	10626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015660	GCTGAA	2	12	10643	10654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015660	GGC	2	6	10706	10711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015660	CGGG	2	8	10740	10747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015660	GCTT	2	8	10749	10756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015660	GCG	2	6	10768	10773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015660	GGC	2	6	10880	10885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015660	CGA	2	6	10953	10958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015660	GCA	2	6	11027	11032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015660	CGC	2	6	11074	11079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015660	GAA	2	6	11086	11091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015660	TGT	2	6	11113	11118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015660	GAA	3	9	11123	11131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015660	GCG	2	6	11148	11153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015660	CAG	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015660	ATT	2	6	11237	11242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015660	GC	4	8	11252	11259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015660	AGA	2	6	11337	11342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015660	GGA	2	6	11387	11392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015660	GGC	2	6	11407	11412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015660	GAA	2	6	11650	11655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015660	TCC	2	6	11702	11707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015660	GGA	2	6	11714	11719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015660	GGT	2	6	11730	11735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015660	GTC	2	6	11744	11749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015660	TCGTG	2	10	11753	11762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015660	GGA	2	6	11856	11861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015660	ATC	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015660	AC	3	6	11907	11912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015660	AC	3	6	12076	12081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015660	CAC	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015660	AGCC	2	8	12140	12147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015660	CCT	2	6	12219	12224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015660	GAT	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015660	GAAAA	2	10	12262	12271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015660	T	6	6	12315	12320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015660	GAT	2	6	12325	12330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015660	ATG	2	6	12331	12336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015660	GGT	2	6	12385	12390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015660	AGG	2	6	12462	12467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015660	CCA	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015660	TGCGTC	2	12	12592	12603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015660	AAT	2	6	12669	12674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015660	A	7	7	12690	12696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015660	AGT	2	6	12713	12718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015660	GTA	2	6	12794	12799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015660	GGAA	2	8	12827	12834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015660	GGC	2	6	12851	12856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015660	AAGC	2	8	12968	12975	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015660	GGA	2	6	13091	13096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015660	GAA	2	6	13097	13102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015660	GCG	2	6	13125	13130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015660	TCCC	2	8	13276	13283	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_015660	CGG	2	6	13300	13305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015660	GGA	2	6	13332	13337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015660	AGT	2	6	13453	13458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015660	CGT	3	9	13583	13591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015660	CACG	2	8	13662	13669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015660	ACC	2	6	13913	13918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015660	AGC	2	6	13993	13998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015660	ACC	2	6	14071	14076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015660	ACC	2	6	14320	14325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015660	G	6	6	14345	14350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015660	GCT	2	6	14374	14379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015660	GCC	2	6	14404	14409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015660	GAG	2	6	14550	14555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015660	CT	3	6	14632	14637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015660	CGG	2	6	14810	14815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015660	GA	3	6	14908	14913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015660	TAC	2	6	14927	14932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015660	GGC	2	6	15067	15072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015660	ACC	2	6	15081	15086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015660	GACA	2	8	15261	15268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015660	GGT	2	6	15304	15309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015660	CGT	2	6	15499	15504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015660	GAG	2	6	15548	15553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015660	C	6	6	15675	15680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_015660	ATCG	2	8	15788	15795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015660	AAC	2	6	15810	15815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015660	GCC	2	6	15823	15828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015660	GACG	2	8	15849	15856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015660	CAT	2	6	15897	15902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015660	TAA	2	6	15913	15918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015660	TTTAT	2	10	16064	16073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015660	AGT	2	6	17174	17179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015660	GTT	2	6	17187	17192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015660	CTA	2	6	17196	17201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015660	ATA	2	6	17202	17207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015660	TA	3	6	18709	18714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015660	T	7	7	18747	18753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015660	GT	3	6	18762	18767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015660	TG	3	6	18780	18785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015660	AGG	2	6	18786	18791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015660	TCCT	2	8	20157	20164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015660	T	6	6	20176	20181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015660	TGT	2	6	20183	20188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015660	T	7	7	20191	20197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015660	A	6	6	20198	20203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015660	ATC	2	6	20226	20231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015660	ATG	2	6	20238	20243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015660	AAT	2	6	20293	20298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015660	ATA	2	6	21840	21845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015660	TAG	2	6	21870	21875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015660	TC	3	6	21886	21891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_015660	GGTG	2	8	21901	21908	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015660	CGG	2	6	21917	21922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015660	ATCC	2	8	21936	21943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015660	TTTTA	2	10	22080	22089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_015660	T	6	6	30293	30298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015660	A	7	7	30682	30688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_015660	ACC	2	6	92981	92986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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